首先，切勿意气用事，打草惊蛇，做好证据保全是上策。 软件商业秘密律师在处理这类案件时，首先考虑的是证据问题，客观事实和法律事实有时是一致的，有时会存在很大的区别甚至是冲突，但软件商业秘密律师关注更多的是法律事实，也就是有证据支持的事实，如果没有证据支持，所有的言说都会变成单方陈述，法院是不会采信的。所以企业老总首先要考虑的是如何固定证据，收集侵权人实施侵犯自己软件商业秘密的证据，切勿意气用事，找一帮人跟侵权人进行理论，这样只会打草惊蛇，让侵权人及早做好防范准备。
第二步，选择何种救济方法对企业来说成本最小趣蕉、成效最大。 在遭遇被侵权时，企业有多种救济渠道，但是在这个时候千万不要滥用救济渠道，或者在对各种救济渠道还不是很了解的情况下，千万不要以为抓住任何一根稻草都能救命。“天下没有免费的午餐”，即使我们的企业老总没有付出经济上的成本，但不当的选择将付出机会成本、时间成本，这导致的成本有可能比经济成本更大、更严重，此时，企业老总应该考虑选择何种救济方式对企业而言，成本最小但成效最大。比较我国目前对软件商业秘密的救济渠道，软件商业秘密刑事救济比软件商业秘密民事、行政救济对企业更有利，为什么这么说呢，软件商业秘密行政救济主陕译要的表现方式是对侵权企业或人员进行罚款，但罚完款后会怎么样呢，继续侵权，这种后果是企业老总不想看到，但在现实生活中屡见不鲜的，可以说根本达不到维权的目的;再看看软件商业秘密民事救济怎么样呢，与软件商业秘密行政救济手段在维权效果上没有实质性的区别，软件商业秘密权利人跟侵权人打了一审诉讼，再打二审诉讼，但侵权人继续实施软件商业秘密侵权行为，且在整个过程中软件商业秘密权利人还要承担较高的举证责任，对于第一次遭遇软件商业秘密侵权的企业来说，完全不知道方向、摸不着头脑，更不用说要完成本身已经很复杂、难度很高的举证责任了。因此，相比较而言，软件商业秘密刑事救济手段对企业泰边雁来说更有利，更能保护软件商业秘密，更好地实现软件商业秘密维权目的，之所以说软件商业秘密刑事救济手段在处理软件商业秘密侵权上更佳，理由在于一旦启动软件商业秘密刑事立案程序，将由公安机关行使打击犯罪的行为，相关侵权行为将停止，不会进一步侵犯软件商业秘密，对其他蠢蠢欲动的侵权者而言，有巨大的心理威慑作用。另外，通过国家公权力机关收集证据，从证据收集效果和证据收集便利程度上看，都比企业自己收集证据要好得多。从侵权行为收益成本上看，软件商业秘密刑事手段导致的后果是涉嫌侵权人可能丧失的不仅是金钱，更恐怖的是面临失去自由的风险，孰轻孰重，软件商业秘密侵权人自有辨识能力。
软件商业秘密是非常专业的领域，作为以技术、研发能力擅长的技术专家、企业高管、企业老总也并一定搞得清楚，在遇到软件商业秘密被侵权时，应当像软件商业秘密律师一样思考，并及时委托专业的软件商业秘密律师进行处理，才能以较小的成本代价实现较好的维权目的和维权成果。