1、适期采收花椒要适时采收，才能达到质量高、损失小的效果。过早采收，色泽淡、香气少、麻味不足；过迟采收，花椒在树上开裂破口、容易落椒，若遇阴雨易变色发霉。花椒果实多在秋季成熟，一般当果实由绿变红、果皮缝合线突起、少量果皮开裂、表现出品种特有的色泽、果皮上椒泡凸起呈半透明状态、种子完全变黑色光亮时，即可采收。因品种不同，成熟期略有不同，早熟种（俗称伏椒）8月中下旬成熟，晚熟种(俗称秋椒)9~10月成熟，如大红袍花椒比小红袍花椒晚熟10~20天。同一品种，因栽培地区不同，其成熟和采收期也有差异，温暖向阳地的花椒成熟早，而背阴地的成熟稍晚。
2、采收前的用具准备采收前应准备的采收工具包括：剪刀、盛装花椒的用具（如背篼、提篮、箩筐或花椒专用装箱）等。这些工具和用具都要求清洁无污染，并用柔软的纱布或尼龙纱窗等作内衬，以防擦伤花椒果皮，擦破油胞,但不能用塑料薄膜等有毒和不透气的物品作内衬。用于运输花椒的工具如汽车等也要求洁净无污染。
3、采收方法花椒采收以手摘为主，也可用剪刀将果实随果穗起剪下再摘取，一般在露水干后的晴天进行。晴天采收的花椒干制后色泽鲜、香气浓、麻味足;阴雨天有露水时采收不易晒干，色泽不鲜亮、香气淡、品质差。采收时，一手握住枝条，一手采摘果穗。由于果穗基部的枝条上着生有皮刺容易扎手指，有的改用剪刀剪，但这样往往伤害顶花芽，对翌年产量有较大影响。采摘时要防止把果穗连枝叶一起摘下，以免损害结果芽，影响明年产量。一般在大椒穗下第一小时间有1个饱满芽，这个芽是翌年的结果芽，要注意保护，不要摘除。弱枝果穗下第一个芽发育不充实，第二个或第三个芽发育，采摘时可抹除第一个芽，保留第二、第三个芽，一起到修剪作用。采收时适当抹除大部分叶丛枝，一般保留三分之一，光腿缺枝部位的叶丛枝适当保留，培养成健壮的结果枝，充实空间，扩大结果部位。目前，一种便携、实用、增效、新型的锯盘电动花椒采摘机已研制成功，花椒产区可进行机械化采摘。
除了晾晒，我们还可以采取人工烘干的方法。人工烘干不受天气条件限制，且烘烤的花椒色泽好，能很好地保持花椒特有的风味。1、烘房烘干法花椒采收后，先集中晾半天到1天，然后装人烘筛送人烘房烘烤，装筛厚度3-4厘米。烘干机内温度达30C时放人鲜椒，烘房初始温度保持在50-60摄氏度,经2-2.5小时后升温至80摄氏度左右，再烘烤8-10小时，花椒含水量小于10%时即可。烘烤过程中要注意排湿和翻筛，开始烘烤时，每隔1小时排湿和翻筛1次，以后随着花椒含水量的降低，排湿和翻筛的间隔时间可适当延长。花椒烘干后降温，去除种子和枝叶等杂物，按标准装袋即为成品。
2、暖炕烘干法将采收的鲜花椒摊放在铺有竹席的暖炕上，保持炕面温度50摄氏度左右。在烘干过程中不要翻动椒果，待椒果自动开裂后方可进行敲打、翻动，分离种子，去除果枝。暖炕烘花椒果，色泽暗红，不如阳光下晒干的果实色泽艳丽。
3、人工烘干法建造人工烘房，面积10平方米，房顶装吊扇1个，墙壁装换气扇1个，烤房内装带烟囱铁炉2-3个，安装铁架或木架，架上摆放宽40厘米、长50厘米的木板砂盘。当烤房内温度达30摄氏度时放人鲜椒，烤房内温度保持30-50摄氏度,经3-4个小时，待8%根果开裂后，将椒果从烤房内取出，并用木棍轻鼓打，使果皮与种子分离后去除种子，将果皮再次放人烘房内烘烤1-3小时、温度控制在55摄氏度。
4、烘干机烘干法花椒烘干机可以控温控湿，根据花椒自身的特性，按照一定的烘干工艺进行烘干，可以达到花椒更好的品质展现。花椒烘干机烘干花椒，可以大幅度的提升烘干效率，提升花椒品质，将原本需要长时间的晾晒过程缩短到更短的时间。烘干机采用PLC智能化电脑控制，达到烘干时间自动停机，无需人工值守，更大程度上的节省人工成本。
(1) 选晴天上午露水干后采收，不能在雨天和有露水时采收，否则使椒颜色暗淡，品质低劣甚至变黑发霉。
(2) 在采收的全过程都要注意轻拿轻放，避免碰破油胞。摘椒时千万不要用手指捏着椒粒，若压破花椒的油泡，造成“跑油椒”或“浸油椒”干制后，香味大减，色泽暗褐，降低了花椒的商品价值。采摘正确的方法是用指甲掐断花椒把，整朵花椒就摘下来了。提醒一下摘花椒之前不要剪指甲。
(3) 采收的花椒要做到无叶、无刺、无枝柄、无油椒、无变色椒。