Needle是EBI网上的一种进行双序列比对的网络版工具,可以清楚地显示比对结果和相关信息,现在简单为大家介绍一下这个比对工具的使用方法以方便进行有关序列比对人员的使用
工具/原料
已准备好的两条比对序列、在线电脑
方法/步骤
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首先登陆EBI主页,点击services
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进入services后点击A to Z,在services A to Z界面有许多网络工具可以根据需要选择自己所需的,这里我们选择下方的EMBOSS Tools
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进入EMBOSS Programs界面,可以看见Needle,下面还有Protein和Nucleotide选项,分别对应蛋白质和核酸,根据自己要比对的对象选择,这里我选择的是蛋白质Protein
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输入自己保存的序列,可手动输入、复制粘贴或上传文件
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在下方点击More options我们还可以根据自己的需要设置比对参数,设置完成后点击Submit进行比对
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下面是比对结果
注意事项
如有帮助勿忘支持!