冷藏干燥这种方法适用于少量的新鲜虫草，可以在冰箱中保存一周左右。具体步骤如下：将新鲜虫草用牙刷轻刷去泥土和残余胎衣，然后用清水冲洗干净。将洗净的虫草撒放于干燥无光照的地面阴晾3个小时左右，使其外部颜色更好看些，阴晾时用粗铁丝网盖上防鼠或者用别的方法。将阴晾好的虫草装入厚塑料袋中，尽量排出空气后密封，然后再套一层厚塑料袋密封。将密封好的塑料袋放入冰箱保鲜层中，随用随取。这种方法的好处是操作简单，可以保持虫草的新鲜度和口感。缺点是保存时间较短，如果超过一周不食用，可能会影响虫草的品质。
高温干燥这种方法适用于大量的新鲜虫草，可以在常温保存一年以上。具体步骤如下：将新鲜虫草用牙刷轻刷去泥土和残余胎衣，然后用清水冲洗干净。将洗净的虫草放入可以控温的微波炉或烤箱里，温度调至80℃~90℃，烤1到3分钟，使其彻底干燥。将烤干的虫草装入厚塑料袋中，尽量排出空气后密封，然后再套一层厚塑料袋密封。将密封好的塑料袋放在阴凉、干燥的地方，避免阳光直射和潮湿。这种方法的好处是可以长期保存虫草，不用担心变质或生虫。缺点是需要一定的设备和技巧，而且可能会损失部分虫草的香气和活性。
冷冻花椒这种方法适用于中等数量的新鲜虫草，可以在冰箱中保存6个月左右。具体步骤如下：将新鲜虫草用牙刷轻刷去泥土和残余胎衣，然后用清水冲洗干净。将洗净的虫草撒放于干燥无光照的地面阴晾3个小时左右，使其外部颜色更好看些，阴晾时用粗铁丝网盖上防鼠或者用别的方法。将阴晾好的虫草装入玻璃罐中，同时放入少量花椒或丹皮，可以起到杀灭细菌和驱虫的作用。将玻璃罐密封后放入冰箱冷冻层中，每30天左右检查一次并以同样的方法晾一次。这种方法的好处是可以延长虫草的保存时间，同时保持虫草的营养成分和药效。缺点是操作稍微复杂些，需要定期检查和晾干。
在保存前要先检查虫草是否有霉变、生虫或变质的迹象，如果有则要及时处理或丢弃。
在保存时要尽量排除空气，避免虫草氧化或变色。
在保存时要注意防止虫草受到挤压或碰撞，避免虫草断裂或损伤。
在食用前要先检查虫草是否有异味、异色或异形，如果有则要谨慎食用或不食用。