MySQL最重要、最与众不同的特性是它的存储引擎架构，这种架构的设计将查询处理（Query Processing）及其他系统任务（Server Task）和数据的存储/提取相分离。这种处理和存储分离的设计可以在使用时根据性能、特性，以及其他需求来选择数据存储的方式。
SHOW ENGINES;
SHOW VARIABLES LIKE '%storage_engine%';
创建新表时如果不指定存储引擎，那么系统就会使用默认存储引擎，MySQL5.5之前的默认存储引擎是MyISAM，5.5之后改为了InnoDB。MySQL中同一个数据库，不同的表格可以选择不同的存储引擎。
MyISAM不支持事务、也不支持外键，其优势是访问的速度快，对事务完整性没有要求或者以SELECT、INSERT为主的应用。每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件。第一个文件的名字以表的名字开始，扩展名指出文件类型。.frm文件存储表定义。数据文件的扩展名为.MYD (MYData)。索引文件的扩展名是.MYI (MYIndex)。 InnoDB存储引擎提供了具有提交、回滚和崩溃恢复能力的事务安全。但是对比MyISAM的存储引擎，InnoDB写的处理效率差一些，并且会占用更多的磁盘空间以保存数据和索引。InnoDB：所有的表都保存在同一个数据文件中，InnoDB表的大小只受限于操作系统文件的大小限制。Myisam只缓存索引，不缓存真实数据；Innodb不仅缓存索引还要缓存真实数据，对内存要求较高，而且内存大小对性能有决定性的影响。 MEMORY存储引擎使用存在于内存中的内容来创建表。MEMORY类型的表访问非常的快，因为它的数据是放在内存中的，并且默认使用HASH索引，但是一旦服务关闭，表中的数据就会丢失。主要用于那些内容变化不频繁的代码表或者作为统计操作的中间结果表。