方舟更新了孵化机制后，结束了远古版本抓龙看脸、野生龙抓完用到穿的年代。 孵化机制分为两块，第一块是孵化，第二块是留痕。
孵化的生物又分为两种，一种是爬行生物，也就是大多数恐龙，采用蛋——幼龙——成龙的形式生长;另一种是哺乳生物，例如河狸、巨犀等，采用妊娠——幼兽——成年兽的方式生长。还有一些生物是不能孵化的或是特殊方式孵化的，这个放在后面再讲。 对于爬行生物的孵化来说，蛋的孵化需要温度的支持，否则蛋在过冷或者过热的情况下均无法正常孵化。
可以对温度造成影响的有：火把(微量增热);篝火(少量增热);立式火把(中量增热);壁炉(大量增热);远古企鹅(中量增热);空调(中等冷热抗性);异齿龙(高冷热抗性)。 只要通过这些方法让蛋不处于过冷过热的情况下，蛋就可以正常孵化。哺乳动物则用妊娠取代了蛋的阶段，也就是说，哺乳动物的培育是不需要调节温度的。
当幼兽出生的时候，你需要领养你的幼兽，幼兽出生的时候是默认为敌对生物，请记得关闭你的孵化区域内的防御性建筑。领养后幼兽在前10%的生长阶段需要玩家手工在幼兽的物品栏添加食物。幼兽的食物消耗量较大，但食物的种类并不影响幼兽的属性，所以尽可能给幼兽喂食简单、易获取的食物。当幼兽的成长阶段超过10%后，就可以自动吃喂食槽里的食物了。
幼兽的成长过程中，可以进行留痕。留痕可以增加生物的属性。生物拥有生命、体力、氧气、食物、负重、近战伤害、移动速度、眩晕共8种属性(水栖生物没有氧气值)，留痕会在生命、负重、氧气、食物、近战攻击、移动速度这6项属性上有所提升，一般情况下提升幅度最高在25%左右。100%留痕的龙会和领养的人有骑手buff(自己留痕的龙自己骑，龙减伤33%，伤害提升33%)，不满留痕的骑手buff按比例下降。
关于变异，有两种，一种是颜色变异，一种是属性变异。两者的发生几率都是5%。颜色变异顾名思义，在其颜色上会产生一些一眼就能看到的变化，属性变异则会使幼龙在其父母的属性的基础上多增加2级的属性。例如霸王龙，变异一次攻击力会使下一代增加10攻击力;变异一次血量会使下一代增加440血量。在基因族谱中的变异点数中，每变异一次，会增加一个点，20个点之内的变异是可能的，超过20个点就不会再变异了。
所以，理论上某一个单一属性是可以变异20次的，例如霸王龙如果进行20次攻击变异，就会比最早先的一代增加200的攻击力。当然这是最理想的状态，实际上需要大量的时间进行尝试和孵化，这样才能培养出一只你理想中的龙!
希望本篇能够帮助各位玩家能够很好的理解游戏中的孵化系统，学会了孵化之后，小伙伴们就能自己去培养自己喜欢的龙类了，最后祝大家游戏愉快。