如何使用cutadapt
工具/原料
cutadapt
方法/步骤
1
1.实现cutadapt 在搜寻引物时--> 默认允许错配和插入缺失代码如下
2
2.实现去除低质量序列的方法代码
3
3.实现去除polyA 尾的序列的方法代码
4
4.实现output.fastq的内容的方法代码
5
5.实现从序列两端切除固定长度的序列的方法代码
6
6.实现从序列末端切除5bp用法代码如下
cutadapt
1.实现cutadapt 在搜寻引物时--> 默认允许错配和插入缺失代码如下
2.实现去除低质量序列的方法代码
3.实现去除polyA 尾的序列的方法代码
4.实现output.fastq的内容的方法代码
5.实现从序列两端切除固定长度的序列的方法代码
6.实现从序列末端切除5bp用法代码如下