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如何使用cutadapt

如何使用cutadapt
工具/原料

cutadapt

方法/步骤
1

1.实现cutadapt 在搜寻引物时--> 默认允许错配和插入缺失代码如下

2

2.实现去除低质量序列的方法代码

3

3.实现去除polyA 尾的序列的方法代码

4

4.实现output.fastq的内容的方法代码

5

5.实现从序列两端切除固定长度的序列的方法代码

6

6.实现从序列末端切除5bp用法代码如下

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