美国著名的玛雅学者西尔瓦努斯·G·莫利认为：玛雅古典城市文明的突然衰落源于落后的生产力和惊人的社会分化。这是目前支持者最多的观点。
玛雅文明是生长于城市的文明，它的一切政治力量、社会文化、精神活动以及所有优秀人物都来自城市。但是，城市却依赖于农业，依赖于农民的供养，也就是说，玛雅文明的发展，从某种意义上说，依赖于玛雅农民的创造。
可是，玛雅的农民几乎全是文盲，没有文化知识，也接触不到文化知识，用最原始的方式、刀耕火种供养着城市，以及城里的贵族。玛雅社会阶级的区分非常严格，分为贵族和农民两大部分，贵族和僧侣们掌握着高度发达的文化知识，住在居高临下的宫殿和庙宇中，忙于研究星象、设计城市，却忽略了发展最基本的生产力，连犁子都没有发明。
城市周围的土地日渐贫瘠，农民不知道施肥，只能到较远的地方开垦新的土地，离城市越来越远，当城市周围的荒地连成一片之后，因为农业生产供应的严重匮乏，饥饿迫使玛雅人弃城迁徙，玛雅古典文明开始崩溃。原始的农业文明孕育了高度发达的城市文明以及科学和艺术，但由于这些文化的发展没有促使农业文明的发展，最后又因其原始的耕作技术无力承担城市的生存而终致毁灭。
养尊处优的贵族知识分子在艰难的岁月中难以为继，更多活下来的是玛雅农民，而他们对于贵族们留下的文字和史书一无所知，玛雅文化自然就销声匿迹了。
20世纪80年代末，一批考古学家、动物学家及营养学家组成的队伍，对玛雅文化200多个遗址进行了6年的考察，他们认为玛雅文化的衰落主要原因是人民的大规模的暴乱。
美国佛罗里达州的地质学家认为：玛雅文明的衰落与太阳活动周期的增强息息相关。太阳活动周期的变动虽然只有1%，却造成了玛雅文明地带的严重干旱，公元9到10实际的大旱，导致玛雅人不得不远走他乡。
美国斯坦福大学地球物理学家指出，地震是摧毁古老文明的杀手，玛雅文明可能毁于地震。公元9世纪晚期的地震将部分玛雅城邦夷为平地，动摇了玛雅统治基础，成为导火索，引发了玛雅社会的动荡。
有人认为入侵者导致玛雅西部地区城市政体的更替，并切断了西部与中心地带的联系，进而加速了玛雅文化的衰落，有很多的证据证明了这一点。但是入侵说也遭到了一些非议。
时至今日，玛雅文化湮没之谜，仍然是不解之谜。