选花卉种子时，要根据养花环境的光照条件，选择适宜的花卉种类。如向南的阳台需选种时，要选择喜光耐热的花卉，如鸡冠花、石竹、凤仙花、一串红、大丽菊、百合类等花卉种子。然后用视觉查看挑选，辨别种子的品质，选种子的籽粒饱满度和均匀度好的，筛掉其中杂质和不完整籽粒，色泽要正常，无虫害、菌瘿或霉变的情况。
选花卉种子还要根据季节选种花卉种类。有些花卉季节性很强，如雏菊、金盏菊、三色堇等，适合秋季播种；鸡冠花、长春花、千日红等适合春、夏季播种；而一串红、四季海棠、万寿菊、百日草等适宜四季播种。选种子时，可以用鼻子闻一闻种子的味道，是否有异味。如种子带有甜味是正常的，发霉的种子带有酸味或酒味。
对于花卉生于主枝和侧枝上的花卉品种，如波斯菊、矮牵牛、金鱼草等，每个果实中的种子重量一般都是由下而上递减，它们所产生的后代在长势上也有显著的差异，要选花色、花形、株形都比较美观，生长健壮、无病虫害能体现品种作为留种母株。对种子简单判断，用手插入种子袋内感觉松散、阻力小、有响声，用手抓种子时，种子容易从手中自然流落，则说明种子好，其中的水分少。
不同种类花卉的种子，种皮构造及种子的化学成分不同，则寿命差别也很大。报春花的种子寿命较短，樱草种子采后就应播种，有的寿命极长，如莲子，因其具有不透性的种皮，生活力可保持多年。种子外皮用牙齿来辨别质量好坏，用牙齿轻轻咬住种子颗粒，加大压力，咬开种子籽粒，感觉费力，声音清脆，软质粒端面掉粉，硬质粒端面整齐，则水分含量低，种子质量好。
有些养花爱好者喜欢自己留种，从选种的角度看，同一单株不同部位的花絮小花所产生的种子，在品种典型性程度上也有不同。一般规律是在种株上最先开的花，要比晚开的花产生更好的种子后代，如花期早、花朵大、花色艳等。可以从听觉上判别，把种子紧紧握住，五指活动，听有无沙沙响声或带有果皮的种子抓起摇动听响声，一般声音越大，水分含量越少，种子质量越好。
为保证种子的质量，最好选择下部花卉所产生的种子，如鸡冠花，以中央花序中下部产生的种子为佳，菊类花卉，着生在花盘边缘的种子最好，能保持其优良形状，花盘中心所结的种子籽粒不壮，优良性状不理想，不宜留种使用。选择种子时也要考虑种子存放的环境，通风干燥，避免太阳光照射，否则会降低发芽力。微生物和病虫害也对种子的寿命有影响。
购买种子时，选购信誉好的企业生产经销的种子，购种时索要购货凭证、产品说明书、种子标签等。
选择种子时，也要看种子标签应当注明作物种类、品种名称、产地、种子经营许可证编号、质量指标、生产年月、生产商名称、地址联系方式等，通过标签内容初步判断种子质量的可靠性。