企业端软件的操作总体比较简单，要完成专用发票的扫描、传输、认证工作，只需按照如下图所示的操作步骤进行：
工具/原料
1
电脑
2
网上认证系统
3
扫描仪
方法/步骤
1
用户将扫描仪接入电脑，并将电脑连接到互联网上后，打开企业端软件，选择相应的扫描仪，进入系统
2
将待认证的抵扣联正确地放置在扫描仪上，点击【专用发票网上认证】或是【机动车/货运票网上认证】对相应的发票类型进行网上认证
3
进入网上认证页面后，点击【单张扫描】或【高速扫描】按钮，软件自动扫描发票图像并识别发票电子数据，扫描识别形成发票电子数据后，请对照抵扣联原件，核对电子数据。如有识别不准确的，依照抵扣联原件，通过键盘手工修改。
4
点击【网上认证】再进行【实时认证】，对于返回结果为“认证通过”的，用户可进行下一步的下载打印通知书的操作；（对于返回结果为“认证未通过”的，请用户仔细核对电子数据与抵扣联原件是否一致，如不一致，可能是扫描识别有误或手工录入有误，根据抵扣联原件校正电子数据后，再次进行传输认证）
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单击【通知书】选择要下载通知书的“所属月份”（默认为当月），然后单击“下载认证结果通知书”按钮。通知书下载完毕后，单击“打印通知书”按钮，打印认证结果通知书和认证结果清单。