孕妇菊花茶性寒、味甘，有极好的祛除火气之效，但孕妇自身免疫力低下、脾胃较为虚弱，食用菊花茶容易刺激肠胃，引起肚疼腹泻等症状，不利于胎儿的健康成长。
过敏体质者在我们的现实生活中有人会对菊花茶过敏，如果喝了菊花茶就会引起皮肤红肿、红疹等过敏现象。所以那些过敏体质的人喝菊花茶反而会有副作用，对自己的健康不利。
寒性体质者寒性体质者畏寒怕冷、身体孱弱、脾胃虚弱、免疫力低下，即使夏季也会有手脚冰凉、腹泻肠胃不适等症状，菊花茶性寒，只会加重其症状，对健康不利。
老人及儿童也许大家认为老人喝菊花茶可以降血压、胆固醇，夏季食用并无大碍，但老人消化功能减退、脾胃较为虚弱，喝菊花茶有引起肠胃疾病的可能性，老人需慎重.小孩处在生长发育的高峰期，阳气正当时，喝菊花茶有削减阳气之效，最好禁止食用。
伤寒感冒者一般情况下，伤寒感冒者都是因为着凉引起的，而菊花茶的属性决定此种感冒患者不适合喝，另外，感冒并伴有咽喉炎者更加不能喝菊花茶了。因为菊花茶有刺激胃酸分泌，加重咽喉炎症的作用，延缓患者复原的时间、降低复原的质量。
随泡随饮，不要隔夜。菊花茶中富含黄酮类物质，具有很好的抗氧化性能，能帮助人体清除体内自由基，有降低胆固醇、抑制血压升高等多种健康作用。但黄酮类物质十分不稳定，很容易被氧化，使茶水失去本来的黄色色泽，变成绿色，其保健作用也会有所下降。因此菊花茶要现泡现饮，最好不要久放。
别放冰糖。体热的人别加冰糖，对体寒体虚的人来说，菊花茶中加些冰糖，能稍微减弱一下寒性，更加适合他们的体质。而对于体热体壮的人，加冰糖就会减弱菊花茶清热的功效，建议可以用果干代替冰糖。
学会科学搭配。无论哪种菊花，性质都偏寒，一般阳虚体质（平时怕冷）和脾胃虚寒（一吃凉东西就胃痛、胃不舒服）的人建议可以用秋桑、枸杞、果干等组方为菊启茶，清肝明目的效果更佳，配枸杞补肝肾，加桑叶防治感冒。菊花味甘，对肝肾有滋养作用，配上滋补肝肾的枸杞，作用得到加强。桑叶与菊花皆能疏散风热，清肝明目，同用可缓解风热感冒初期的发热、头痛等症状。
菊花与鸡肉、猪肉一起煮会中毒，而且也不可以和芹菜一起食用。
建议可以用菊启茶这种较为经典的中医组方茶泡饮。该组方茶由桑叶、枸杞子、杭白菊、陈皮等药食同源的中药材组成，配比科学，口感香醇，无副作用，可长期做茶泡饮，对肝火旺盛导致的各种症状有很好的疗效。