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怎样利用BLAST分析一段未知基因序列

如果你手头上正好有一段刚刚获得的基因序列,不管是哪里得来的,首先你应该知道这段序列可能的类别,与哪些基因相似性最高。这时你需要用到BLAST这一工具来简单初步分析你的序列。下面小编跟大家一起学习BLAST!
工具/原料

NCBI,BLAST,基因序列

方法/步骤
1

百度搜索NCBI在百度搜索栏内键入“NCBI”,点击回车或“百度一下”,选择第一个带有“官网”标志的链接,进入NCBI主页。

2

点击右侧BLAST进入主页后,我们看到有很多选项和功能,纷乱复杂,让人摸不到头绪。我们且不管这些,找到最右侧BLAST,下图箭头所指,点击进入。

3

点击nucleotide blast既然我们要搜索查找一段基因序列,我们需要点击Basic BLAST中的nucleotide blast来查找,点击此项进入。

4

输入基因序列因为我们也不确定这段基因到底是什么,我们需要先进行模糊查找。在Enter Query Sequence框内输入你的目的基因,或者下载,点击“选择文件”,这两种均可。

6

结果分析记过几秒钟的分析后,结果出现了,我们看到与这段基因相似性最高的是Duck hepatitis A virus strain,软件同时给出了相似性得分情况和其对应的序列号。下图中前几位基因序列与未知基因的相似度最高,说明这段未知基因与这类病毒非常接近。

注意事项

本方法对于初学分子生物学的朋友非常实用,方法很简单,希望帮到有需要的亲们!

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