日常生活中，由于对灵芝选购常识的了解不足或是个人购买时主观意识的随意性，使得绝大多数人在选购灵芝时表现得比较盲目。
人们平时所服用的灵芝，较为常见的有两种：一是柞木栽培的，另一种则为袋料培育的。柞木灵芝是将灵芝的菌种培植在柞木上，袋料灵芝就是将灵芝置于塑料袋里培育。
袋料培育的灵芝：在我国南方的大部分地区，普遍使用的原料多为粮食秸秆、棉籽壳、稻草、甘蔗渣、石膏等来培育袋料灵芝。袋料灵芝的生长周期很短，一般为3个月左右，这种袋料培养出来的灵芝手感轻，外观不成熟，干品的话多数会变形，味道只是稍苦，基本没有好成色，相较于柞木灵芝的品质逊色不少。并且由于南方气温高，所以一年内可以采摘灵芝两次，而灵芝孢子在高温下还没成熟就可释放，所以这样的灵芝产量虽高，药效却很差，同时还伴有农药和化肥残余。
柞木灵芝：柞木灵芝主要出产在北方地区，主要集中在东北的长白山。长白山是国家自然保护区，那里森林覆盖率大，天然野生柞木资源尤其丰富。长白山常年处于寒冷的天气中，无霜期短，昼夜温差大，空气洁净度极高，这种低温环境下生长的灵芝(赤芝)质地紧密，生长周期长(长白山灵芝生长周期长达三年左右)且有效成分（灵芝多糖、灵芝多肽、三萜类、有机锗等）含量高，是其它产地的灵芝所无法比拟的，所以在中医界流行一句话——东北长白山灵芝是“道地灵芝”。
人工栽培的灵芝在色泽、形状、大小都比较统一、有规则，菌盖肾形、半圆形或近圆形；盖面黄褐色至红褐色，盖缘为淡黄褐色，有同心环带和环沟，并有纵皱纹，表面有光泽。而野生或者仿野生环境下生长达到灵芝在色泽上不统一，形状大小不一，表面没有明显光泽，会有虫咬损噬痕迹。
药用赤芝：外形呈伞状，菌盖肾形、半圆形或近圆形，直径10～18cm，厚1～2cm。皮壳坚硬，黄褐色至红褐色，有光泽，具环状棱纹和辐射状皱纹，边缘薄而平截，常稍内卷。菌肉白色至淡棕色。菌柄圆柱形，侧生，少偏生，长7～15cm，直径1～3.5cm，红褐色至紫褐色，光亮。孢子细小，黄褐色。气微香，味苦涩紫芝：皮壳紫黑色，有漆样光泽。菌肉锈褐色。菌柄长17～23cm。
生物学记载的灵芝分108种，有青芝、赤芝、白芝、紫芝等。不是每种灵芝都是有效的。一般药厂选择赤芝，而赤芝又分32种。购买灵芝者须小心辩认，深褐色、无异味。