1. 吸吸衰竭症 症状：鳝苗在清水中漂养时，头吻端长时间伸出水面，下颌部始终处于吸气膨大状态，并且惊动不下沉或下沉后头部又立即伸出水面，俗称“打桩”。外观体表无机械损伤，无充血现象，黏液正常，解剖脏器无炎症，但血液暗红。 防治：①苗种收购时尽量减少中间环节，并低密度带水草运输；②苗种下池（箱）前，用双黄连、电解多维、青霉素等消毒。③苗种下池（箱）时，尽可能剔除“打桩”的苗种。
2. 脱水症 症状：鳝苗在漂养时，开始表现为游动异常有力、快捷，轻握鳝体无柔软感，略僵硬，外观体表微微泛红。漂养10小时后，鳝苗呈吸吸衰竭症状。下池后，鳝苗拒食并附在水草之上，机体僵硬，黏液减少，继发细菌感染，皮肤坏死，48小时后开始死亡，5天后达死亡高峰期，死亡率达90%以上。 防治：①低密度带水草运输鳝苗，容器要留有40%以上的空间；②开食后，投喂维生素C、维生素K、尼克酸或多维；③下池（箱）前，使用抗酸剂、电解多维等浸泡。
3. 赤皮病 症状：病鳝机体瘦弱，体表局部出血、发炎，尤其是腹部两侧最为明显，呈块状病灶，严重时腐烂至骨。 防治：①用1毫克/升聚维酮碘溶液全池泼洒；②用磺胺噻唑拌饵投喂，第一天用量为10克/100千克黄鳝，第二至第六天用量减半；③用2.5%食盐溶液浸泡病鳝10～20分钟或用5%碘酒涂抹患处；④用0.05毫克/升明矾溶液全池泼洒，两天后再用生石灰液泼洒水面。
4. 肠炎病 症状：病鳝行动缓慢，食欲减退，头部颜色特别黑，腹部膨大，出现红斑，轻压腹部有血和黄色黏液流出，解剖可见肠道充血、发炎，肠内无食物。 防治：①每100千克黄鳝用磺胺胍10克或用1千克大蒜+0.5千克食盐拌饵投喂，每天1次，连续6天；②在内服药物的同时，外用生石灰液或季胺盐络合碘制剂泼洒。
5. 腐皮病 症状：体表皮肤出现许多圆形或椭圆形大小不等的红斑，腹部两侧最多。病情严重时，皮肤呈点状溃烂，并向肌肉延伸，形成不规则的小洞，殃及内部脏器而死亡。 防治：①每100千克黄鳝用磺胺胍10克，拌饵投喂，每天1次，3～6天为1个疗程；②每100千克黄鳝用磺胺脒2克+水蚯蚓1千克，拌饵投喂，连用5天；③每立方米水体用红霉素25万国际单位，每天1次，连续3天。
黄鳝属于无鳞鱼，对漂白粉、高锰酸钾等强刺激性药物反应敏感，养殖过程中要避免使用，否则会导致黄鳝产生应激，从而影响其正常摄食和成活率。