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如何比较两个蛋白的同源性

不同物种间的很多蛋白存在同源性,所谓的同源性即某两种蛋白虽然不在同一物种之间,但是他们可能会来自同一个祖先,经后来的进化演变在不同物种间发挥作用
方法/步骤
1

利用生物信息学方法,比较两个蛋白的编码基因的序列相似性,如blast可以根据其评分(e值)来预测两个蛋白的同源性

3

分析蛋白的空间结构和拓扑结构

4

分析蛋白的转录时段

5

分析该蛋白在细胞中的定位,可以用一些融合蛋白,用tag等标记

6

可以看一下编码该蛋白的开放阅读框在染色体上的位置是否一致

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