1.可有效地脱除热敏性物质中轻分子物质产品物质的脱臭——姜油的脱臭产品物质的脱溶——辣椒红色素脱溶产品物质中脱单体——酚醛树脂中单体酚的脱除
2.脱除产品中重物质及颜色 精细化学品中常常有一些重分子物质、甚至金属离子等难以分离，分子蒸馏为此提供了有效方法。 乳酸精制，其它如芥酸、亚油酸、亚麻酸、二聚酸、芥酸酰胺、硬脂酸单甘酯、高碳醇的精制及脱色，也需要采用分子蒸馏技术。
3.降低热敏性物质热损伤 鱼油乙酯脱色及浓缩，与传统的釜式蒸馏比较，可明显看出分子蒸馏技术的优势：不仅产品得率高，而且产品品质好，绝大多数的天然或合成香精香料都属于热敏性物质，均适合采用分子蒸馏技术提纯。
5.优化产品的合成工艺，提高产品的质量。 烷基多苷精制，烷基多苷合成工艺中，脂肪醇过量有利于合成反应，但又直接影响产品纯度，采用分子蒸馏可有效脱醇，使合成工艺中脂肪醇的使用可根据工艺需要而定，提高了产品收率和质量
1、分子蒸馏适用于不同物质分子量差别较大的液体混合物系的分离，特别是同系物的分离，分子量必须要有一定差别。
2、分子蒸馏也可用于分子量接近但性质差别较大的物质的分离，如沸点差较大、分子量接近的物系的分离。
3、分子蒸馏特别适用于高沸点、热敏性、易氧化（或易聚合）物质的分离。
4、分子蒸馏适宜于附加值较高或社会效益较大的物质的分离。
5、分子蒸馏不适宜于同分异钩体的分离。
1、利用分子蒸馏单甘油酯的自乳化特点，将一份单酯加于10-20份水中，加热至60-75℃，搅拌溶解，制成水合甘油酯，HLB值增加到9-10，亲水性增加，冷却后为稳定均匀的乳液，将其投入原料，进行其它工艺操作。建议选择此法，可以最好发挥分子蒸馏单甘酯的功效。 适合冷食，液体饮料，固体饮料，蛋糕油，馒头、面条、方便面、香肠等含油量小的产品。
2、 由于其为油脂类衍生物，与油脂有完全相融性，易溶于油脂，将蒸馏甘油单酯与油脂一起加热（≥65℃呈液体状）熔化后再与水相混合使用。 适合生产蛋糕油、起酥油、饼干、蛋糕、西点、火腿肠、肉制品罐头等含油量大的产品。
3、 将其与其他原料粉混合，使用时在60-75℃水温下溶解。 适用于生产糕点粉、饺子粉、淀粉或面包、面粉改良剂等产品。