种植无蔓中国南瓜时不需要进行整枝，一般也不进行整枝，农村房前屋后等粗放型栽培，一般也不进行整枝，施足底肥后，任其自然生长。爬地栽培的中国南瓜，对于生长势弱、分枝性不强的品种，可以不进行整枝。但对于生长势旺、侧枝发生多的品种应进行整枝，否则容易引起化瓜。 采用精细栽培，则应注意及时整枝。对于一些种子价格较高的品种，为了减少种子用量，一般也要进行整枝。 合理整枝，可使养分相对集中，瓜蔓生长粗壮，利于坐果和增大果型。还能增大叶片，提高叶的质量，延长叶的寿命，从而增强光合作用，减少病害。
整枝方法主要分为保留主蔓整枝和苗期摘心法两种。
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保留主蔓整枝主要有单蔓式整枝和一主一侧(或两侧)式整枝。单蔓式整枝，是把侧枝全部摘除，只留一条主蔓结瓜。一般早熟品种，特别是密植栽培的中国南瓜，多用此法整枝。一主一侧(或两侧)式整枝，是保留主蔓， 选留1~2条健壮侧蔓，去除其余所有侧蔓，采用此法整枝，由于主蔓始终保持了顶端优势，结果较早，但主蔓与各侧蔓间长势参差不齐，开花授粉时间不一，果实成熟不一致。
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苗期摘心法主要分为双蔓式整枝和多蔓式整枝，在苗期即进行摘心，然后选留长势健壮且相近的2条侧蔓或多条侧蔓进行结瓜。因为苗期摘心后，选留的瓜蔓长势相对一致，开花坐果时间及节位相近，果形正常，成熟期相对一致，商品率高，因此从加强果实商品性和便于管理方面考虑，在生产中多采用此法进行整枝。
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整枝也可以不拘于某种形式，主要是根据品种生长势和分枝能力的强弱，以及当地栽培习惯等来决定整枝方式，也可以多种方法并用。在留足一定数目的瓜后，进行摘心，以促进瓜的发育。
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双蔓式整枝和多蔓式整枝，一般用于中晚熟品种，就是在主蔓第五至第七节时摘心，而后留下2~3个侧枝，在侧枝上留瓜。主蔓也可以不摘心，而在主蔓基部留2~3个强壮的侧蔓，把其他的侧枝摘除。不拘形式的整枝方法，就是对生长过旺或徒长的植株，适当地摘除一部分侧枝、弱枝，叶片过密处适当地打叶，这样有利于防止植株徒长，改善植株通风透光条件，减少化瓜现象的发生。
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