不规律的睡眠及压力，会影响内分泌代谢，造成皮肤水分流失，容易导致皱纹出现、皮肤暗淡、长暗疮、黑眼圈加重等。一般来说，皮肤在晚上10点到晚2点进入晚间保养状态。如果长时间熬夜，就会破坏人体内分泌和神经系统的正常循环。神经系统失调会是皮肤出现干燥，弹性差，缺乏光泽等问题；而内分泌失调会是皮肤出现暗疮，粉刺，黄褐班，黑斑等问题。熬夜等于是超负荷用眼，对眼睛的伤害不仅仅是变成“熊猫黑眼圈”，更重要的是，长期熬夜、超负荷用眼，导致视力功能性减退。
熬夜的人，剥夺了胃肠道休息的机会，导致消化性胃溃疡、十二指肠溃疡、功能性消化不良、腹胀、腹痛等。
熬夜时人处于紧张状态，得不到放松，造成血管收缩异常，血压比正常人高，容易诱发高血压或者加重病情。现在心脑血管疾病发病率逐渐增多且越来越年轻化，常熬夜或是诱因之一。
正常来说，人的交感神经应该是夜间休息，白天兴奋，来支持人一天的工作。而熬夜者的交感神经却是在夜晚兴奋，所谓一张一弛，熬夜后的第二天白天，交感神经就难以充分兴奋了。这样人在白天会没有精神，头昏脑涨，记忆力减退，注意力不集中，反应迟钝，健忘以及头晕，头痛等问题。时间长了，长期缺乏睡眠，会令人皮肤暗黄粗糙、免疫能力下降，同时还会导致失眠、健忘、易怒、焦虑不安等症状。
对于男性，熬夜会导致造血不足，伤肝、肝脏对于阴茎的勃起其决定作用。对于女性，专家称，在临床上，普遍认为工作压力大、情绪紧张、夜生活多熬夜至睡眠不足，以及不良的饮食习惯等因素，导致人体内分泌失调，是乳腺增生疾病高发的主要原因。对孕妇的影响也尤为的大。
长久熬夜会导致肥胖、掉头发。
长久熬夜还会导致突发性耳聋。长期睡眠不足，血管处于紧张状态，这样就会使内耳血供不足，极易发生耳鸣和突发性耳聋。由于现代社会生存竞争的压力大，年轻白领大多工作压力大、长期疲劳、喜欢熬夜。专家分析，人长期处于压力过大和身心过度疲劳状态，会阻碍内耳血液供应，一旦受到外界刺激更容易导致失聪。而沉重的工作压力亦会令本身患有耳鸣的人士病情恶化。
专家提醒，应当坚持抵制‘非正当性熬夜’，建立规律的作息时间。如果因为工作关系不得不熬夜，中间应休息一段时间，另外要补充营养。