1987年日本宫崎医科大学的须见洋行检索了200多种食品，发展纳豆中有溶纤维蛋白酶，并命名为纳豆激酶（Nattkinase）。据报道每克湿纳豆含有相当于现在临床使用的尿激酶1600IU，他们用生理盐水将溶酶提取，研究了溶纤酶的酶学性质。纳豆溶纤酶PI为8.6,在自然状态下比较稳定,能耐60摄氏度;在PH从7升至12时,室温下可稳定10min，当PH低于5 时，则极不稳定，与小麦提取液、肉汤或血清蛋白和胃液粘蛋白混合后，稳定性明显增加，甚至在酸性条件下也能保持75%以上的活性。动物试验表明：纳豆溶纤酶无论是通过胃，还是在肠道中都不会活性。
纳豆溶纤酶的体外溶栓作用非常明显。将生理盐水提取的溶纤酶加到血纤维平板上，发现平板由原来的不透明变成透明的圆圈，或者将溶纤酶直接加入有凝血的试管中，发现会将凝血溶解，证明了该酶的体外溶血栓作用。实验发现纳豆溶纤酶还能使纤维蛋白溶酶原和尿激酶原激活成纤维蛋白溶酶和尿激酶，从而促进溶栓效果。
用狗作实验研究了纳豆溶纤酶的体内溶栓作用。首先从狗的股大静脉注入牛血清纤维蛋白质白原和凝血酶，使其在静脉中形成体内静脉血栓。然后实验组喂4颗溶纤酶胶囊（250mg干粉/囊），对照组喂安慰剂。实验结果表明：喂安慰剂的无明显的溶栓现象，而实验组服药后5 个小时，血栓完全溶解，表现了很好的体内溶栓作用。
在人体上也进行了纳豆溶纤酶的溶栓实验。让12名健康人吃市场出售的纳豆，对照组吃同等数量的煮熟大豆，测定了血栓溶解时间和血栓溶解面积。食用纳豆后可以明显地缩短血栓溶解时间以及增加血栓溶解面积和血栓分解产物，而对照组血栓溶解时间没有减少、血栓溶解面积为零。其酶的作用可维持2~8小时，表现出较长的酶作用时间，这将有利于临床应用。另外，食用组血浆组织溶纤酶原激活剂（TPA）也显著增加，表明纳豆溶纤酶为体内TPA的激活剂，可激活内源TPA的产生，所以使TPA的量增加，有利于溶栓作用。可见，纳豆是一种安全的食用血栓预防剂
从血液中分离的酶的分析结果表明：纳豆溶纤酶能象尿激酶一样经口摄入后从肠道吸收，并作用于血管内此细胞或肝脏细胞合成生物体本身的溶纤酶，因此，纳豆溶纤酶不仅具有直接溶纤作用，还有间接溶纤作用。另外，值得注意的是，日本人自古有食用纳豆的传统，而今更有所发扬，最近的一项调查表明，在日本每人年均纳豆消费量为2kg，虽然纳豆中含有大量的溶纤酶，但至今还未发现吃纳豆有何毒副作用。某些研究者认为，纳豆中不仅含有NK等溶栓物质，同时还含有Vitamin K等凝血物质，即对血液的抗凝和促凝有双向调节作用
目前，纳豆激酶和链激酶衍生物（一种链球菌所产生的糖蛋白）、葡激酶（为金葡萄球菌溶原性噬菌体所含有的一种蛋白质）、蚓激酶（提取自蚯蚓，产品有：江中“博洛克”）等等一起被视为是第二代溶栓剂。而且，性能比后三者优越。制作纳豆的原料—大豆，含有丰富的卵磷脂、亚油酸以及生理活性蛋白质和肽，他们降血脂、降血清胆固醇及维护血管弹性，进而预防冠心病、脑中风、高血压。这已是广为认知的。加之纳豆溶纤酶也可降低血液粘稠度，因此，将纳豆作为一种主食，经常食用是可以预防心血管性疾病或衰老症的。
抗菌作用 早在没有抗生素的年代，日本人就将纳豆用做“药物”来治疗痢疾、斑疹伤寒和其它腹泻性疾病。1936年，Arima Genkai 上尉（日本海军军医）进行 了“纳豆抗痢疾作用的实验研究”，他发现纳豆能很快使对任何治疗无效的副伤寒病人的粪便检测不到副伤寒细菌。他的论文证实了纳豆的抗菌作用(Naval Medical journal,University of Hokkaido Medical journal 1936—1938)。之后，日本的一系列研究证明，纳豆芽孢杆菌分泌一种肽类抗生素，同时也发现了其它抗生机制，能对一些重要肠道致病菌，如病原性大肠杆菌、沙门氏菌、霍乱弧菌、阿米巴变形痢疾原虫等起杀灭或抑制作用。如具体实验证明纳豆菌可抑制O111、O144大肠杆菌的增殖，将O157同纳豆菌一起培养，发现纳豆菌也能显著地抑制O157的增殖，在第4 天就检不出 O157 大肠杆菌；所以认为纳豆可预防O157引起的食物中毒。纳豆菌还可灭活葡萄球肠毒素、杀死霍乱菌、伤寒菌等，因此可预防和治疗某些对症的胃肠道感染及食物中毒。
减少骨质疏松的产生 天然VK有两种，VK1主要存在于海藻、动物肝脏和某些蔬菜；VK2则存在于奶酪（cheese）、日本豆酱（miso）和纳豆（natto）等等发酵食品中。以纳豆的含量最为丰富，每百克含VK2高达870mg。骨骼是由富含^—谷氨酸的骨胶原蛋白和钙接合而成的。日本学者认为，维生素K（VK）参与骨骼的形成和促进骨骼的沉积（促进^—谷氨酸和钙接合），维持骨骼的完整和功能。统计结果表明，血液中VK2 水平低的人，比VK2 水平高的人骨质疏松发生率高。骨质疏松容易导致骨折，特别是中老年的女性发生率较高。据东京大学医学院折茂肇教授研究认为，骨折的人血液中促进骨形成的VK2 的浓度低，仅为正常人的1/2，服用VK2 能缓和腰疼，增加骨的重量，因此推荐食用VK2 丰富的食品。大豆经枯草杆菌发酵后，会产生VK2 。该大学医学院的金木教授进行了流行病学调查发现，消费比通常食品VK2 高几百倍的纳豆多的地区（日本富士市以东地区），骨折发生率显著低于纳豆消费量低的地区（日本富士市以西地区）。也有报导认为，常吃纳豆能预防骨质疏松是加为纳豆的黏性成分中富含多聚谷氨酸，能促进肠道对钙的吸收。总之，日本研究者们确信纳豆能预防骨质疏松症（Yuhobika March 1998 and Mainichi News morning edition,July 25,1994）。
3．4抗癌效果 纳豆抗癌机制的研究结果可总结为两个方面：首先，制作纳豆的原料—大豆，本身含有抗癌物质，如植物雌酚（phytoestrogen）、黄铜和异黄酮(flanovoid,isoflavone)等。Dean Ornish博士 (Preventive Medicine Research Institute in Sausalito, California)认为日本男性前列腺癌的发生率只有美国的1/4，而旅居美国的日侨男性前列腺癌的发生率也陡然升高，这是因为在日本本土生活的人对大豆制品的消费量远远高于美国人而食肉量远低于美国人的缘故。同时指出，起抗癌作用的是黄酮类物质。很多研究都证实了大豆中含有抗癌物质，除了酚类、黄铜类，大豆中还富含膳食纤维（可促进大肠蠕动和肠内毒素的排除）以及抗癌元素—硒，它们可以预防乳腺癌、前列腺癌、皮肤癌、肾癌、尿道 癌、大肠癌等。
3．5提高蛋白质消化率、调整肠道功能 枯草杆菌是不产生毒素和对人体没有病原性的安全菌株，它能分泌很多酶类、蛋白酶、纤维素酶、脂肪酶、果胶酶、尿酶、过氧化物酶、过氧化氢酶等等。利用它发酵大豆的消化率从原来的50%增加到90%以上。大豆蛋白质将有50%—60%转化为肽和氨基酸，其中10%是氨基酸，特别是谷氨酸较多，同时还会产生独特的风味物质，如丁酸、丙酸和丁二酸等。纳豆中含有丰富的膳食纤维，食用后可防止便秘，预防大肠癌和直肠癌，还会防止甘油三酯的增加和降低血清胆固醇等效果，另外，纳豆菌在肠中发芽增殖，能在肠内生活几周，分泌各种酶和维生素，可促进小肠粘膜细胞的增殖和保证肠功能正常。
3．6其它营养、医药功效 纳豆发扬了大豆的营养与保健功能，除上述医药活性物质产生的功能外，因为纳豆含有丰富的CB2 ，亚油酸、亚麻酸、植物雌激素（phytoestrogen）、异黄酮（isoflavone）等，因此还具有抗衰老、美容护肤、健脑、提高记忆力，减肥等健康保健功能。大豆中丰富的亚油酸或亚麻酸是我们人体所必需的不饱和脂肪酸，是人体构件细胞膜、视网膜和神经的重要物质，前列腺素的前体，参与血液胆固醇的代谢，对维护上皮组织的完整性和功能有不可或缺的作用，因此具有改善和维持血管壁的弹性、保护皮肤、营养脑神经要归功于日本女性长年吃的豆制品和其它含卵磷脂、VE多的食品。这种说法可能有些勉强，但实际上任何比较讲究的高档天然美容护肤品一般都不会缺少卵磷脂和VE的。卵磷脂是人体重要的磷脂，在体内可由必需脂肪酸合成，但也需要由食物中获得，有类似必需脂肪酸的功能，同时也是良好的天然乳化剂，对血液胆固醇也有起乳化运输和促排泄作用，目前已广泛应用食品加工和高档日用化学品的加工。至于VE（生育酚），这种在粮豆类胚芽中富含的维生素，则是以其显著的抗氧化、防癌、防衰老、美容护肤等功能为人们所熟知。近年来，在医药和功能性食品领域对植物黄酮类和酚类引起了较大的关注和开发热情。
这类物质如植物雌酚、异黄酮等对人体具有类似激素的作用，也有人称其为类激素。在美国，进入更年期的妇女，尤其是更年期反应大的女性，保健医生的处方里总是建议多吃豆制品，如纳豆、豆腐等等，而尽量少用或不用激素类药。这是因为大豆及其豆制品中含有的上述类激素所带来的反作用。有些研究者认为，大豆制品中的某些蛋白质或肽或促进甲状腺对甲状腺激素的分泌，从而促进糖和脂肪的分解代谢，提高和保持精力，有利于减肥。
近年来，我国也开始进行纳豆溶纤酶（纳豆激酶，NK）的研究，南京农业大学从全国各地的样品中分离到20多株纳豆发酵菌株，研究结果表明其中有5 株除有较好的发酵特性之外，溶纤酶活性超过了从日本引进的对照株。目前正在通过物理化学诱变来进一步提高溶纤酶活性。另外，黑龙江省科学院应用微生物研究所、中科院化工冶金研究所等单位都在进行“纳豆溶纤酶工业开发的研究”，基本上都进入中试生产阶段。总之，纳豆是一种优良的保健功能食品，值得大力开发利用。